史序凡例卷一风暑湿燥温热卷二咽喉耳目口齿咳嗽咳血喘胸痹虚劳不寐心悸健忘卷三肝风呕吐噎格脘痛腹痛泄泻痢疟卷四肿胀遗精遗尿淋浊疝气疮疡调经带下胎前产后
自叙序凡例卷之一先天脉镜叙先天脉镜论云诊脉捷要歌照脉玄窍诀照脉口诀三焦照六腑脾照五脏十八脉形歌五运体性六气合来为邪脉左手太过脉右手太过脉左手不及脉诀右手不及脉诀调摄养生却妄远色贵达调息除烦节食慎劳酌饮
伤寒心境别集
总论出产择地土收采按时月藏留防耗坏贸易辨假真咀片分根梢制造资水火治疗用气味药剂别君臣四气五味七情七方十剂五用修合条例服饵先后各经主治引使用药法象卷之一草部上人参黄耆甘草白术生干地黄当归牛膝黄精远志石菖
叙正文跋
序序凡例卷一述原引种预防禁忌辨证卷二论治（上）卷三论治（下）卷四运气选案
颅顖经
序题辞凡例总论第一延医法论第二表论第三里论第四寒论第五热论第六虚论第七实论第八辨惊风之误论第九不可饿论第十治痘论第十一治疹论第十二
太医局诸科程文格
《神农本草经》简介邵序张序孙序周序上经（上品）玉石丹沙云母玉泉石钟乳涅石消石朴消滑石石胆空青曾青禹余粮太乙余粮白石英紫石英青石、赤石、黄石、白石、黑石脂等白青扁青草菖蒲鞠华人参天门冬甘草干地黄术菟丝子