卷一四诊总括察色听声审病切脉虎口三关部位脉纹形色初生门（上）拭口（附下胎毒法）断脐浴儿藏胎衣法天德月空剃头不啼不乳眼不开吐不止不小便不大便大小便不通肛门内合噤口撮口脐湿脐疮脐突脐风天钓内钓盘肠气痛卷二
前序序石山先生自赞卷一痈疽脉一治疮脉诀七恶五善二诸恶疮五逆三定痈死地分四背上九处不可病痈五痈发有不可治六发背治之难易七占色候生死八痈之源有五九生痈所感不同十肺肝肾痈症十一痈生原于脏腑十二辨脏腑内疮十三
林序皇甫序序例卷一精神五脏论第一五脏变第二五脏六腑阴阳表里第三五脏六腑官第四五脏大小六腑应候第五十二原第六十二经水第七四海第八气息周身五十营四时十分漏刻第九营气第十营卫三焦第十一阴阳清浊精气津液血脉第
幼科发微赋卷之一十三科预养以培其元一胎养以保其真二蓐养以防其变三回气捷法拭口时法浴儿法断脐法嗜儿法刮泡法通便法贴囟法牛黄法鞠养以防其疾四辨小儿寿夭辨小儿形色辨小儿脉息辨小儿脉证治五脏证治总论肝脏证治心
第1部分第2部分第3部分
序卷之一风病诸候上（凡二十九论）一、中风候二、风候三、风口噤候四、风舌强不得语候五、风失音不语候六、贼风候七、风痉候八、风角弓反张候九、风口候十、柔风候十一、风痱候十二、风退候十三、风偏枯候十四、风四
卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
医经小学
卷第一治伤寒时气、温疫初起方治疫气伤寒，三日以后不解者方治伤寒中风方治伤寒汗出不解如疟方治伤寒胸闷、腹满方治伤寒后呕恶不食虚羸方治伤寒后烦渴及口干方治伤寒后下利脓血及发斑方治伤寒鼻衄、喉痛、疮方治伤寒
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一